Во время правления Матиаса императорский оркестр переехал в Вену, и в Чехию приезжал уже только по особым случаям. Среди придворных дворянских оркестров выделялись оркестры епископов из города Оломоуц, а именно оркестр Карла Лихтенштейна Кастелкома (1664-1695) и оркестр епископа Шраттенбаха (1711-1738). Оба оркестра играли в моравских городах Оломоуц и Кромержиж.

Первый оперный спектакль состоялся в Чехии предположительно во время коронования Фердинанда II в 1627 году. С тех пор оперные представление регулярно устраивались по случаю приезда императорской семьи в Прагу. С начала 18-ого века в Праге и в Брно гастролировали итальянские оперные труппы. Однако, ни одна труппа не останавливалась в Чехии на более продолжительное время. В 1723 году, по случаю коронования императора Карла VI, была показана опера композитора Йоганна Йозефа Фукса (1660-1741) Constanza e fortezza (Постоянность и мужество). Оперу исполняли лучшие европейские певцы и музыканты, для спектакля были подготовлены костюмы и декорации ослепительной красоты. Под впечатлением императорского спектакля в 1724 г. граф Шпорк решил основать оперный театр в своем замке Кукс. Руководителем этой оперной труппы стал Антонио Дензио.

Выдающейся личностью чешского барокко был композитор, поэт и органист Адам Михна из Отрадовиц (1600-1676). Его песня «Chtíc, aby spal» («Хочу, чтобы спал») сохранилась и исполняется в народе до сих пор. Михна также издал собрание песен под названием «Чешская Мариинская музыка» (1647) и «Священная музыка» (1661).

Самыми яркими представителями чешского барокко являются Зеленка и Черногорский. Ян Дисмас Зеленка (1679-1745) учился музыке в Вене и в Италии. Оригинальность его мелодий отличала Зеленку от итальянских и немецких современников. Искусство Зеленки высоко оценили и И.С. Бах и Г.Ф.Телеманн.

Богуслав Матей Черногорский (1684-1742) родился в чешском городке Нимбурк. О жизни этого композитора почти ничего неизвестно. Несмотря на славу и популярность композитора при жизни, до наших дней сохранились лишь маленькие фрагменты его творчества. Известен его мотет Laudater Jesus Christus - великолепная вокальная фуга, далее кантата Regina coeli, и также несколько композиций для органа. Черногорский основал всю композиторскую школу, к его ученикам принадлежат Йозеф Фердинанд Сегер, Ян Зах и Франтишек Тума.